1.營養(yǎng)。由于原材料本身的營養(yǎng)成分較低或發(fā)酵生產(chǎn)過程，一些企業(yè)的有機(jī)肥發(fā)酵，其營養(yǎng)成分不合格。此外，一些工廠甚至沒有實(shí)驗(yàn)室，因此一批產(chǎn)品已經(jīng)進(jìn)入市場。一些企業(yè)發(fā)現(xiàn)營養(yǎng)成分不足，但他們不愿意添加化肥補(bǔ)充劑，這也使這些產(chǎn)品進(jìn)入市場。沒有化肥登記證的企業(yè)生產(chǎn)的產(chǎn)品在市場上不流通。它們通常直接面向用戶，尤其難以監(jiān)督。

2.pH值。pH值在原料本身就有所不同，在發(fā)酵過程中，pH值也有很大的變化。如果發(fā)酵過程沒有得到很好的控制，就有可能發(fā)現(xiàn)pH值在8.5以上或者低于5.5。尤其是酸性過大的產(chǎn)品會導(dǎo)致作物生長受阻或死亡，而過堿的有機(jī)肥由于南方土壤普遍偏酸，危害不大。

3.氯離子含量。一般來說，沒有人會測試氯離子的含量，但有些原材料含有大量的氯離子，特別是在嚴(yán)重避免氯的作物上，會有嚴(yán)重的問題。一些制造商還在有機(jī)肥料中加入氯化銨，以改善總營養(yǎng)中的氮，這也會導(dǎo)致氯離子含量的增加，影響作物的生長。

4.含鹽量。肥料含鹽量高，就像在有限的田地里撒一包食鹽，農(nóng)作物受到很大影響。一般來說，生活污泥.廚房垃圾等原料含鹽量高，不耐鹽的作物會出現(xiàn)黃葉.掉葉.萎蔫.死亡等現(xiàn)象。當(dāng)堆肥EC值小于9.0ms/cm時，聶永豐認(rèn)為堆肥EC值小于9.0ms/cm時，對種子發(fā)芽沒有抑制作用。

5.陽離子交換量。一般來說，腐爛的有機(jī)肥料具有較大的陽離子交換量和保持肥料肥力[2]，具有較強(qiáng)的緩沖能力，對pH值和鹽有很好的緩沖效果，對保持土壤良好狀態(tài)起著非常重要的作用。如果沒有腐爛的有機(jī)肥料，甚至沒有在陽光下出售的糞便，陽離子交換量非常低，不能起到應(yīng)有的緩沖作用。相反，它還會危及土壤本身的緩沖作用，導(dǎo)致作物生長障礙。

6.腐殖酸。新鮮原料幾乎不含腐殖酸，腐殖酸是在有機(jī)肥發(fā)酵生產(chǎn)過程中不斷產(chǎn)生的，尤其是高溫發(fā)酵(50℃以上)。腐殖酸與銨.鉀.鈉結(jié)合，有刺激作物生長的作用，也有吸引作用，還可以提高作物的抗性，促進(jìn)生產(chǎn)，促進(jìn)發(fā)芽，腐殖酸可以提高土壤緩沖能力，因?yàn)樗鼈兊慕粨Q能力。

7.小分子脂肪酸。認(rèn)為低級脂肪酸對種子萌發(fā)和植物生長有不利影響。小分子脂肪酸容易引起飛行，更容易觀察，一般來說，小分子脂肪酸存在于未成熟的材料中，如新鮮雞糞。其危害是，小分子脂肪酸可以抑制種子的發(fā)芽，抑制根系生長。

8.有機(jī)肥料直接與作物接觸：一些用戶擔(dān)心肥料效果不夠，或者希望盡快生效。使用時，有機(jī)肥料直接與作物接觸，會導(dǎo)致嚴(yán)重的幼苗燃燒和死亡。

9.新鮮糞便：新鮮糞便中含有大量的病原菌和寄生蟲直接使用，直接使用會危害作物根系影響種子萌發(fā)，滋生病蟲害。